Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp13P33435 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp13P33435 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp13P33435 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp13P33435 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mmp13P33435 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mmp13P33435 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mmp13P33435 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mmp13P33435 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Mmp13P33435 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mmp13P33435 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp13P33435 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp13P33435 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mmp13P33435 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mmp13P33435 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mmp13P33435 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mmp13P33435 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mmp13P33435 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mmp13P33435 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp13P33435 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp13P33435 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp13P33435 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp13P33435 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp13P33435 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mmp13P33435 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mmp13P33435 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mmp13P33435 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mmp13P33435 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp13P33435 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp13P33435 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mmp13P33435 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mmp13P33435 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mmp13P33435 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp13P33435 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mmp13P33435 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mmp13P33435 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mmp13P33435 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mmp13P33435 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp13P33435 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp13P33435 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp13P33435 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp13P33435 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp13P33435 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mmp13P33435 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mmp13P33435 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mmp13P33435 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp13P33435 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mmp13P33435 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp13P33435 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp13P33435 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mmp13P33435 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp13P33435 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mmp13P33435 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp13P33435 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp13P33435 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp13P33435 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp13P33435 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp13P33435 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mmp13P33435 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp13P33435 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp13P33435 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mmp13P33435 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp13P33435 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mmp13P33435 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp13P33435 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp13P33435 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mmp13P33435 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp13P33435 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp13P33435 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp13P33435 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mmp13P33435 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp13P33435 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp13P33435 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp13P33435 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mmp13P33435 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp13P33435 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp13P33435 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp13P33435 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp13P33435 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp13P33435 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mmp13P33435 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp13P33435 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp13P33435 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp13P33435 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp13P33435 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mmp13P33435 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mmp13P33435 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms