Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk4P30285 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk4P30285 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk4P30285 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk4P30285 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk4P30285 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk4P30285 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk4P30285 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk4P30285 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk4P30285 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk4P30285 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk4P30285 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk4P30285 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk4P30285 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk4P30285 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk4P30285 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk4P30285 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdk4P30285 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdk4P30285 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdk4P30285 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk4P30285 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk4P30285 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk4P30285 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk4P30285 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk4P30285 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk4P30285 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk4P30285 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk4P30285 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk4P30285 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk4P30285 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk4P30285 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk4P30285 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk4P30285 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk4P30285 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk4P30285 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk4P30285 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk4P30285 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk4P30285 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk4P30285 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk4P30285 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk4P30285 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk4P30285 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk4P30285 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk4P30285 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk4P30285 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk4P30285 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk4P30285 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk4P30285 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk4P30285 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk4P30285 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk4P30285 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk4P30285 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk4P30285 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk4P30285 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk4P30285 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk4P30285 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk4P30285 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk4P30285 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk4P30285 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk4P30285 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk4P30285 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk4P30285 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk4P30285 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk4P30285 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk4P30285 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk4P30285 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Cdk4P30285 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk4P30285 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk4P30285 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk4P30285 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdk4P30285 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdk4P30285 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdk4P30285 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdk4P30285 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdk4P30285 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdk4P30285 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdk4P30285 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdk4P30285 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdk4P30285 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdk4P30285 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdk4P30285 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdk4P30285 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cdk4P30285 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdk4P30285 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdk4P30285 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdk4P30285 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdk4P30285 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdk4P30285 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cdk4P30285 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdk4P30285 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdk4P30285 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdk4P30285 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdk4P30285 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdk4P30285 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdk4P30285 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdk4P30285 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdk4P30285 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk4P30285 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cdk4P30285 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cdk4P30285 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms