Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Msr1P30204 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Msr1P30204 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msr1P30204 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msr1P30204 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Msr1P30204 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msr1P30204 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msr1P30204 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Msr1P30204 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Msr1P30204 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msr1P30204 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Msr1P30204 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msr1P30204 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Msr1P30204 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Msr1P30204 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msr1P30204 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msr1P30204 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msr1P30204 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msr1P30204 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Msr1P30204 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Msr1P30204 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Msr1P30204 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Msr1P30204 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msr1P30204 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Msr1P30204 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Msr1P30204 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Msr1P30204 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Msr1P30204 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Msr1P30204 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msr1P30204 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msr1P30204 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Msr1P30204 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msr1P30204 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msr1P30204 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Msr1P30204 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msr1P30204 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msr1P30204 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Msr1P30204 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msr1P30204 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Msr1P30204 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msr1P30204 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Msr1P30204 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Msr1P30204 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msr1P30204 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Msr1P30204 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msr1P30204 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Msr1P30204 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msr1P30204 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msr1P30204 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msr1P30204 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msr1P30204 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Msr1P30204 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Msr1P30204 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msr1P30204 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msr1P30204 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msr1P30204 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Msr1P30204 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Msr1P30204 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msr1P30204 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msr1P30204 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msr1P30204 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Msr1P30204 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msr1P30204 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msr1P30204 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msr1P30204 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msr1P30204 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Msr1P30204 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msr1P30204 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Msr1P30204 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msr1P30204 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Msr1P30204 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msr1P30204 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msr1P30204 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msr1P30204 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msr1P30204 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msr1P30204 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msr1P30204 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Msr1P30204 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msr1P30204 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msr1P30204 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msr1P30204 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Msr1P30204 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msr1P30204 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Msr1P30204 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msr1P30204 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Msr1P30204 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Msr1P30204 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msr1P30204 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msr1P30204 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Msr1P30204 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msr1P30204 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Msr1P30204 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msr1P30204 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msr1P30204 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msr1P30204 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msr1P30204 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Msr1P30204 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Msr1P30204 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msr1P30204 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Msr1P30204 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms