Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Casp1P29452 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Casp1P29452 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Casp1P29452 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Casp1P29452 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Casp1P29452 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Casp1P29452 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Casp1P29452 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Casp1P29452 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Casp1P29452 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Casp1P29452 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Casp1P29452 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Casp1P29452 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Casp1P29452 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Casp1P29452 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Casp1P29452 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Casp1P29452 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Casp1P29452 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Casp1P29452 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Casp1P29452 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Casp1P29452 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Casp1P29452 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Casp1P29452 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Casp1P29452 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Casp1P29452 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Casp1P29452 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Casp1P29452 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Casp1P29452 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Casp1P29452 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Casp1P29452 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Casp1P29452 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Casp1P29452 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Casp1P29452 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Casp1P29452 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Casp1P29452 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Casp1P29452 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Casp1P29452 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Casp1P29452 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Casp1P29452 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Casp1P29452 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Casp1P29452 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Casp1P29452 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Casp1P29452 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Casp1P29452 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Casp1P29452 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Casp1P29452 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Casp1P29452 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Casp1P29452 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Casp1P29452 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Casp1P29452 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Casp1P29452 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Casp1P29452 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Casp1P29452 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Casp1P29452 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Casp1P29452 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Casp1P29452 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Casp1P29452 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Casp1P29452 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Casp1P29452 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Casp1P29452 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Casp1P29452 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Casp1P29452 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Casp1P29452 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Casp1P29452 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Casp1P29452 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Casp1P29452 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Casp1P29452 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Casp1P29452 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Casp1P29452 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Casp1P29452 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Casp1P29452 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Casp1P29452 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Casp1P29452 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Casp1P29452 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Casp1P29452 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Casp1P29452 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Casp1P29452 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Casp1P29452 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Casp1P29452 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Casp1P29452 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Casp1P29452 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Casp1P29452 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Casp1P29452 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Casp1P29452 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Casp1P29452 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Casp1P29452 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Casp1P29452 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Casp1P29452 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Casp1P29452 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Casp1P29452 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Casp1P29452 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Casp1P29452 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Casp1P29452 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Casp1P29452 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Casp1P29452 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Casp1P29452 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Casp1P29452 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Casp1P29452 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Casp1P29452 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Casp1P29452 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms