Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mmp3P28862 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mmp3P28862 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mmp3P28862 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mmp3P28862 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mmp3P28862 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mmp3P28862 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mmp3P28862 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mmp3P28862 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mmp3P28862 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Mmp3P28862 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Mmp3P28862 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mmp3P28862 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mmp3P28862 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mmp3P28862 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mmp3P28862 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mmp3P28862 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mmp3P28862 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mmp3P28862 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mmp3P28862 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mmp3P28862 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mmp3P28862 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mmp3P28862 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Mmp3P28862 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mmp3P28862 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mmp3P28862 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mmp3P28862 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mmp3P28862 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mmp3P28862 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mmp3P28862 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mmp3P28862 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mmp3P28862 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mmp3P28862 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mmp3P28862 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mmp3P28862 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mmp3P28862 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mmp3P28862 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mmp3P28862 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mmp3P28862 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Mmp3P28862 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mmp3P28862 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mmp3P28862 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mmp3P28862 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mmp3P28862 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mmp3P28862 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mmp3P28862 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mmp3P28862 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mmp3P28862 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mmp3P28862 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Mmp3P28862 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mmp3P28862 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mmp3P28862 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mmp3P28862 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mmp3P28862 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mmp3P28862 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mmp3P28862 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mmp3P28862 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mmp3P28862 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mmp3P28862 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mmp3P28862 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mmp3P28862 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Mmp3P28862 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mmp3P28862 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mmp3P28862 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mmp3P28862 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mmp3P28862 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mmp3P28862 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mmp3P28862 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mmp3P28862 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mmp3P28862 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mmp3P28862 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mmp3P28862 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mmp3P28862 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mmp3P28862 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mmp3P28862 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mmp3P28862 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mmp3P28862 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mmp3P28862 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mmp3P28862 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mmp3P28862 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mmp3P28862 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mmp3P28862 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mmp3P28862 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mmp3P28862 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mmp3P28862 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mmp3P28862 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Mmp3P28862 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mmp3P28862 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mmp3P28862 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mmp3P28862 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Mmp3P28862 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mmp3P28862 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mmp3P28862 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mmp3P28862 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mmp3P28862 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mmp3P28862 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mmp3P28862 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mmp3P28862 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mmp3P28862 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Mmp3P28862 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms