Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sept4P28661 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sept4P28661 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sept4P28661 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sept4P28661 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sept4P28661 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Sept4P28661 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sept4P28661 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sept4P28661 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sept4P28661 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sept4P28661 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sept4P28661 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sept4P28661 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sept4P28661 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sept4P28661 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sept4P28661 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sept4P28661 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sept4P28661 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sept4P28661 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sept4P28661 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sept4P28661 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sept4P28661 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sept4P28661 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sept4P28661 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sept4P28661 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sept4P28661 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sept4P28661 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sept4P28661 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sept4P28661 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sept4P28661 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sept4P28661 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sept4P28661 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Sept4P28661 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sept4P28661 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sept4P28661 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sept4P28661 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sept4P28661 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sept4P28661 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Sept4P28661 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sept4P28661 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sept4P28661 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sept4P28661 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sept4P28661 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sept4P28661 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sept4P28661 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sept4P28661 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sept4P28661 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sept4P28661 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sept4P28661 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sept4P28661 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sept4P28661 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sept4P28661 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sept4P28661 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Sept4P28661 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sept4P28661 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sept4P28661 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sept4P28661 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sept4P28661 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sept4P28661 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sept4P28661 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sept4P28661 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sept4P28661 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Sept4P28661 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sept4P28661 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sept4P28661 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sept4P28661 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sept4P28661 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Sept4P28661 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sept4P28661 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sept4P28661 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sept4P28661 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sept4P28661 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sept4P28661 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sept4P28661 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sept4P28661 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sept4P28661 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sept4P28661 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sept4P28661 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sept4P28661 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sept4P28661 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sept4P28661 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sept4P28661 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sept4P28661 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sept4P28661 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Sept4P28661 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sept4P28661 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sept4P28661 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sept4P28661 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sept4P28661 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sept4P28661 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sept4P28661 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Sept4P28661 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sept4P28661 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sept4P28661 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sept4P28661 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sept4P28661 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sept4P28661 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sept4P28661 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sept4P28661 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sept4P28661 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms