Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dusp1P28563 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dusp1P28563 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dusp1P28563 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dusp1P28563 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dusp1P28563 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dusp1P28563 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dusp1P28563 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dusp1P28563 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dusp1P28563 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dusp1P28563 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dusp1P28563 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dusp1P28563 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Dusp1P28563 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dusp1P28563 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dusp1P28563 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dusp1P28563 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dusp1P28563 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dusp1P28563 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Dusp1P28563 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dusp1P28563 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dusp1P28563 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dusp1P28563 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dusp1P28563 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dusp1P28563 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dusp1P28563 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dusp1P28563 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dusp1P28563 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dusp1P28563 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dusp1P28563 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dusp1P28563 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dusp1P28563 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dusp1P28563 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Dusp1P28563 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dusp1P28563 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dusp1P28563 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dusp1P28563 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dusp1P28563 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dusp1P28563 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dusp1P28563 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dusp1P28563 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dusp1P28563 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dusp1P28563 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dusp1P28563 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dusp1P28563 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dusp1P28563 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dusp1P28563 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dusp1P28563 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dusp1P28563 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Dusp1P28563 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dusp1P28563 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dusp1P28563 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dusp1P28563 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dusp1P28563 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dusp1P28563 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dusp1P28563 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dusp1P28563 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dusp1P28563 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dusp1P28563 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dusp1P28563 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dusp1P28563 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dusp1P28563 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Dusp1P28563 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dusp1P28563 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dusp1P28563 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dusp1P28563 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dusp1P28563 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dusp1P28563 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dusp1P28563 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dusp1P28563 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dusp1P28563 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dusp1P28563 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dusp1P28563 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dusp1P28563 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dusp1P28563 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dusp1P28563 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dusp1P28563 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dusp1P28563 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dusp1P28563 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dusp1P28563 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dusp1P28563 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dusp1P28563 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Dusp1P28563 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dusp1P28563 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dusp1P28563 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dusp1P28563 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp1P28563 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp1P28563 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dusp1P28563 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp1P28563 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp1P28563 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp1P28563 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dusp1P28563 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp1P28563 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp1P28563 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp1P28563 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Dusp1P28563 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dusp1P28563 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Dusp1P28563 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms