Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-DMaP28078 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-DMaP28078 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-DMaP28078 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-DMaP28078 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-DMaP28078 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-DMaP28078 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-DMaP28078 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-DMaP28078 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-DMaP28078 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-DMaP28078 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-DMaP28078 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-DMaP28078 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-DMaP28078 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-DMaP28078 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-DMaP28078 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-DMaP28078 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-DMaP28078 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-DMaP28078 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-DMaP28078 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-DMaP28078 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-DMaP28078 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-DMaP28078 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-DMaP28078 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-DMaP28078 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-DMaP28078 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
H2-DMaP28078 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
H2-DMaP28078 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-DMaP28078 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-DMaP28078 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-DMaP28078 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-DMaP28078 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-DMaP28078 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-DMaP28078 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-DMaP28078 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-DMaP28078 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-DMaP28078 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-DMaP28078 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-DMaP28078 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-DMaP28078 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
H2-DMaP28078 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-DMaP28078 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-DMaP28078 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-DMaP28078 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-DMaP28078 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-DMaP28078 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-DMaP28078 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-DMaP28078 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-DMaP28078 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-DMaP28078 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-DMaP28078 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
H2-DMaP28078 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-DMaP28078 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-DMaP28078 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-DMaP28078 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-DMaP28078 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-DMaP28078 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
H2-DMaP28078 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2-DMaP28078 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-DMaP28078 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2-DMaP28078 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-DMaP28078 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-DMaP28078 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2-DMaP28078 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2-DMaP28078 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-DMaP28078 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
H2-DMaP28078 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-DMaP28078 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-DMaP28078 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-DMaP28078 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
H2-DMaP28078 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-DMaP28078 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-DMaP28078 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-DMaP28078 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-DMaP28078 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
H2-DMaP28078 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-DMaP28078 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms