Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctnna1P26231 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctnna1P26231 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctnna1P26231 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnna1P26231 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnna1P26231 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnna1P26231 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnna1P26231 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctnna1P26231 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctnna1P26231 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctnna1P26231 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctnna1P26231 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctnna1P26231 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctnna1P26231 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctnna1P26231 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctnna1P26231 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctnna1P26231 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctnna1P26231 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ctnna1P26231 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctnna1P26231 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctnna1P26231 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnna1P26231 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnna1P26231 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctnna1P26231 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnna1P26231 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnna1P26231 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnna1P26231 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctnna1P26231 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctnna1P26231 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctnna1P26231 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctnna1P26231 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctnna1P26231 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctnna1P26231 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctnna1P26231 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctnna1P26231 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctnna1P26231 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctnna1P26231 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctnna1P26231 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctnna1P26231 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctnna1P26231 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctnna1P26231 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctnna1P26231 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctnna1P26231 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctnna1P26231 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctnna1P26231 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctnna1P26231 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctnna1P26231 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctnna1P26231 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctnna1P26231 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctnna1P26231 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctnna1P26231 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctnna1P26231 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctnna1P26231 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctnna1P26231 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctnna1P26231 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnna1P26231 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnna1P26231 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnna1P26231 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnna1P26231 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnna1P26231 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnna1P26231 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnna1P26231 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnna1P26231 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ctnna1P26231 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ctnna1P26231 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctnna1P26231 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctnna1P26231 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctnna1P26231 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctnna1P26231 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctnna1P26231 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctnna1P26231 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctnna1P26231 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctnna1P26231 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctnna1P26231 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctnna1P26231 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctnna1P26231 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctnna1P26231 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctnna1P26231 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctnna1P26231 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctnna1P26231 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnna1P26231 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnna1P26231 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnna1P26231 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctnna1P26231 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnna1P26231 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnna1P26231 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnna1P26231 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnna1P26231 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctnna1P26231 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctnna1P26231 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnna1P26231 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnna1P26231 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctnna1P26231 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctnna1P26231 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnna1P26231 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnna1P26231 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctnna1P26231 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnna1P26231 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnna1P26231 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnna1P26231 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms