Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Itgb7P26011 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Itgb7P26011 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Itgb7P26011 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Itgb7P26011 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Itgb7P26011 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Itgb7P26011 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Itgb7P26011 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Itgb7P26011 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Itgb7P26011 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Itgb7P26011 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Itgb7P26011 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Itgb7P26011 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Itgb7P26011 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Itgb7P26011 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Itgb7P26011 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Itgb7P26011 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Itgb7P26011 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Itgb7P26011 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Itgb7P26011 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Itgb7P26011 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Itgb7P26011 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Itgb7P26011 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Itgb7P26011 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Itgb7P26011 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Itgb7P26011 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Itgb7P26011 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Itgb7P26011 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Itgb7P26011 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Itgb7P26011 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Itgb7P26011 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Itgb7P26011 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Itgb7P26011 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Itgb7P26011 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Itgb7P26011 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Itgb7P26011 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Itgb7P26011 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Itgb7P26011 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Itgb7P26011 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itgb7P26011 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itgb7P26011 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itgb7P26011 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Itgb7P26011 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Itgb7P26011 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Itgb7P26011 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Itgb7P26011 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Itgb7P26011 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Itgb7P26011 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Itgb7P26011 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Itgb7P26011 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itgb7P26011 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Itgb7P26011 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itgb7P26011 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Itgb7P26011 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Itgb7P26011 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Itgb7P26011 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Itgb7P26011 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Itgb7P26011 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Itgb7P26011 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Itgb7P26011 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Itgb7P26011 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Itgb7P26011 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Itgb7P26011 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Itgb7P26011 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Itgb7P26011 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Itgb7P26011 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Itgb7P26011 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Itgb7P26011 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Itgb7P26011 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Itgb7P26011 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Itgb7P26011 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Itgb7P26011 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Itgb7P26011 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Itgb7P26011 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Itgb7P26011 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Itgb7P26011 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Itgb7P26011 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Itgb7P26011 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Itgb7P26011 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Itgb7P26011 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Itgb7P26011 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Itgb7P26011 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Itgb7P26011 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Itgb7P26011 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Itgb7P26011 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Itgb7P26011 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Itgb7P26011 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Itgb7P26011 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Itgb7P26011 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Itgb7P26011 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Itgb7P26011 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Itgb7P26011 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Itgb7P26011 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Itgb7P26011 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Itgb7P26011 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Itgb7P26011 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Itgb7P26011 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Itgb7P26011 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Itgb7P26011 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Itgb7P26011 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms