Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxd12P23812 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxd12P23812 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxd12P23812 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxd12P23812 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxd12P23812 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxd12P23812 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxd12P23812 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxd12P23812 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxd12P23812 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxd12P23812 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd12P23812 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd12P23812 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxd12P23812 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxd12P23812 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxd12P23812 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxd12P23812 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxd12P23812 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxd12P23812 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxd12P23812 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxd12P23812 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxd12P23812 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxd12P23812 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hoxd12P23812 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxd12P23812 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxd12P23812 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxd12P23812 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxd12P23812 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd12P23812 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd12P23812 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd12P23812 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd12P23812 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxd12P23812 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxd12P23812 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxd12P23812 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxd12P23812 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxd12P23812 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxd12P23812 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxd12P23812 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxd12P23812 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxd12P23812 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxd12P23812 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxd12P23812 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxd12P23812 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxd12P23812 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd12P23812 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd12P23812 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd12P23812 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd12P23812 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd12P23812 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd12P23812 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxd12P23812 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxd12P23812 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxd12P23812 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxd12P23812 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxd12P23812 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxd12P23812 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxd12P23812 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxd12P23812 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxd12P23812 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxd12P23812 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd12P23812 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd12P23812 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxd12P23812 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxd12P23812 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxd12P23812 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxd12P23812 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxd12P23812 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxd12P23812 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxd12P23812 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxd12P23812 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxd12P23812 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxd12P23812 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxd12P23812 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxd12P23812 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxd12P23812 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxd12P23812 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxd12P23812 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxd12P23812 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxd12P23812 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxd12P23812 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxd12P23812 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxd12P23812 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd12P23812 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd12P23812 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd12P23812 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxd12P23812 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxd12P23812 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxd12P23812 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxd12P23812 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxd12P23812 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxd12P23812 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxd12P23812 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxd12P23812 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxd12P23812 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxd12P23812 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxd12P23812 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxd12P23812 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxd12P23812 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd12P23812 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms