Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Edn1P22387 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Edn1P22387 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Edn1P22387 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Edn1P22387 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Edn1P22387 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Edn1P22387 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Edn1P22387 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Edn1P22387 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Edn1P22387 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Edn1P22387 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Edn1P22387 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Edn1P22387 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Edn1P22387 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edn1P22387 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edn1P22387 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edn1P22387 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edn1P22387 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edn1P22387 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Edn1P22387 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Edn1P22387 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edn1P22387 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edn1P22387 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Edn1P22387 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edn1P22387 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Edn1P22387 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Edn1P22387 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Edn1P22387 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Edn1P22387 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edn1P22387 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edn1P22387 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edn1P22387 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Edn1P22387 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edn1P22387 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edn1P22387 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Edn1P22387 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Edn1P22387 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Edn1P22387 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edn1P22387 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Edn1P22387 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edn1P22387 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edn1P22387 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edn1P22387 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edn1P22387 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Edn1P22387 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Edn1P22387 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edn1P22387 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Edn1P22387 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Edn1P22387 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Edn1P22387 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Edn1P22387 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Edn1P22387 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edn1P22387 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edn1P22387 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Edn1P22387 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms