Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmnb2P21619 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmnb2P21619 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmnb2P21619 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmnb2P21619 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmnb2P21619 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmnb2P21619 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmnb2P21619 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmnb2P21619 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmnb2P21619 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmnb2P21619 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmnb2P21619 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmnb2P21619 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmnb2P21619 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmnb2P21619 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmnb2P21619 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmnb2P21619 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmnb2P21619 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmnb2P21619 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmnb2P21619 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmnb2P21619 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmnb2P21619 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmnb2P21619 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lmnb2P21619 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmnb2P21619 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmnb2P21619 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmnb2P21619 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmnb2P21619 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmnb2P21619 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmnb2P21619 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmnb2P21619 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmnb2P21619 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmnb2P21619 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmnb2P21619 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmnb2P21619 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmnb2P21619 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmnb2P21619 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmnb2P21619 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmnb2P21619 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmnb2P21619 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmnb2P21619 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmnb2P21619 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmnb2P21619 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmnb2P21619 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmnb2P21619 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmnb2P21619 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmnb2P21619 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lmnb2P21619 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmnb2P21619 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmnb2P21619 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmnb2P21619 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmnb2P21619 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmnb2P21619 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmnb2P21619 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmnb2P21619 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmnb2P21619 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmnb2P21619 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmnb2P21619 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmnb2P21619 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmnb2P21619 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmnb2P21619 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmnb2P21619 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmnb2P21619 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmnb2P21619 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmnb2P21619 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmnb2P21619 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmnb2P21619 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lmnb2P21619 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lmnb2P21619 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmnb2P21619 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmnb2P21619 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmnb2P21619 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmnb2P21619 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmnb2P21619 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmnb2P21619 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmnb2P21619 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmnb2P21619 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmnb2P21619 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmnb2P21619 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmnb2P21619 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms