Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl13aP19253 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl13aP19253 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13aP19253 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl13aP19253 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13aP19253 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13aP19253 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13aP19253 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13aP19253 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13aP19253 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl13aP19253 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl13aP19253 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl13aP19253 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl13aP19253 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl13aP19253 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl13aP19253 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl13aP19253 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl13aP19253 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl13aP19253 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl13aP19253 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl13aP19253 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl13aP19253 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rpl13aP19253 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl13aP19253 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl13aP19253 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl13aP19253 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl13aP19253 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl13aP19253 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl13aP19253 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl13aP19253 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl13aP19253 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl13aP19253 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl13aP19253 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl13aP19253 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl13aP19253 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl13aP19253 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl13aP19253 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl13aP19253 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl13aP19253 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl13aP19253 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl13aP19253 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl13aP19253 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl13aP19253 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl13aP19253 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl13aP19253 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl13aP19253 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl13aP19253 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl13aP19253 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl13aP19253 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl13aP19253 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl13aP19253 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl13aP19253 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl13aP19253 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl13aP19253 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl13aP19253 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl13aP19253 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl13aP19253 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl13aP19253 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl13aP19253 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl13aP19253 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl13aP19253 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13aP19253 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl13aP19253 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms