Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnnc1P19123 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnnc1P19123 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnnc1P19123 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnnc1P19123 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnnc1P19123 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnnc1P19123 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnnc1P19123 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnnc1P19123 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnnc1P19123 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnc1P19123 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnc1P19123 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tnnc1P19123 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnc1P19123 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnc1P19123 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnc1P19123 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnc1P19123 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tnnc1P19123 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnnc1P19123 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tnnc1P19123 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tnnc1P19123 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tnnc1P19123 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnc1P19123 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnc1P19123 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnnc1P19123 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tnnc1P19123 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tnnc1P19123 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnc1P19123 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnc1P19123 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnnc1P19123 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnnc1P19123 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnnc1P19123 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnnc1P19123 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnnc1P19123 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnnc1P19123 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnnc1P19123 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnnc1P19123 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnc1P19123 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnc1P19123 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnnc1P19123 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnnc1P19123 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnnc1P19123 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnnc1P19123 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnnc1P19123 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnnc1P19123 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnnc1P19123 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnnc1P19123 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnnc1P19123 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnnc1P19123 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnnc1P19123 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnnc1P19123 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnnc1P19123 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnnc1P19123 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnnc1P19123 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnnc1P19123 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnnc1P19123 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnnc1P19123 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnnc1P19123 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnnc1P19123 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnnc1P19123 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnnc1P19123 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnnc1P19123 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnnc1P19123 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnnc1P19123 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnnc1P19123 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnnc1P19123 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnc1P19123 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnnc1P19123 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnnc1P19123 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnnc1P19123 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnnc1P19123 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnnc1P19123 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnc1P19123 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnc1P19123 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnc1P19123 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnc1P19123 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnnc1P19123 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnnc1P19123 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnnc1P19123 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnnc1P19123 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms