Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RargP18911 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RargP18911 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RargP18911 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RargP18911 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RargP18911 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RargP18911 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RargP18911 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RargP18911 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RargP18911 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RargP18911 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RargP18911 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RargP18911 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RargP18911 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RargP18911 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RargP18911 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RargP18911 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RargP18911 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RargP18911 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RargP18911 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RargP18911 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RargP18911 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RargP18911 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RargP18911 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RargP18911 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RargP18911 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RargP18911 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RargP18911 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RargP18911 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RargP18911 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RargP18911 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RargP18911 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RargP18911 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RargP18911 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RargP18911 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RargP18911 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RargP18911 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RargP18911 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RargP18911 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RargP18911 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RargP18911 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RargP18911 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RargP18911 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RargP18911 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RargP18911 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RargP18911 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RargP18911 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RargP18911 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RargP18911 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RargP18911 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RargP18911 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RargP18911 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RargP18911 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RargP18911 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RargP18911 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RargP18911 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RargP18911 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RargP18911 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RargP18911 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RargP18911 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RargP18911 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RargP18911 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RargP18911 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RargP18911 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RargP18911 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RargP18911 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RargP18911 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RargP18911 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RargP18911 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RargP18911 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RargP18911 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RargP18911 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RargP18911 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RargP18911 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RargP18911 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RargP18911 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RargP18911 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RargP18911 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RargP18911 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RargP18911 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RargP18911 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RargP18911 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RargP18911 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RargP18911 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RargP18911 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RargP18911 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RargP18911 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RargP18911 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RargP18911 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RargP18911 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RargP18911 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RargP18911 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RargP18911 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RargP18911 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RargP18911 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RargP18911 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RargP18911 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RargP18911 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RargP18911 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RargP18911 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms