Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pou4f1P17208 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pou4f1P17208 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pou4f1P17208 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pou4f1P17208 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pou4f1P17208 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pou4f1P17208 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pou4f1P17208 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pou4f1P17208 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pou4f1P17208 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pou4f1P17208 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pou4f1P17208 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pou4f1P17208 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pou4f1P17208 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pou4f1P17208 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pou4f1P17208 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pou4f1P17208 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pou4f1P17208 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pou4f1P17208 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pou4f1P17208 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pou4f1P17208 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pou4f1P17208 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pou4f1P17208 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pou4f1P17208 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pou4f1P17208 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pou4f1P17208 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pou4f1P17208 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pou4f1P17208 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pou4f1P17208 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pou4f1P17208 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pou4f1P17208 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pou4f1P17208 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pou4f1P17208 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pou4f1P17208 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pou4f1P17208 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pou4f1P17208 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou4f1P17208 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou4f1P17208 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou4f1P17208 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou4f1P17208 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou4f1P17208 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou4f1P17208 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pou4f1P17208 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pou4f1P17208 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou4f1P17208 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou4f1P17208 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou4f1P17208 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou4f1P17208 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou4f1P17208 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pou4f1P17208 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pou4f1P17208 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pou4f1P17208 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pou4f1P17208 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pou4f1P17208 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou4f1P17208 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pou4f1P17208 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou4f1P17208 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou4f1P17208 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou4f1P17208 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou4f1P17208 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou4f1P17208 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou4f1P17208 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pou4f1P17208 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pou4f1P17208 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pou4f1P17208 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pou4f1P17208 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pou4f1P17208 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pou4f1P17208 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pou4f1P17208 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pou4f1P17208 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pou4f1P17208 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pou4f1P17208 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pou4f1P17208 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pou4f1P17208 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pou4f1P17208 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pou4f1P17208 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou4f1P17208 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou4f1P17208 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pou4f1P17208 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pou4f1P17208 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pou4f1P17208 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pou4f1P17208 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pou4f1P17208 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pou4f1P17208 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pou4f1P17208 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pou4f1P17208 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pou4f1P17208 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pou4f1P17208 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pou4f1P17208 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pou4f1P17208 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pou4f1P17208 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pou4f1P17208 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pou4f1P17208 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pou4f1P17208 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pou4f1P17208 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pou4f1P17208 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pou4f1P17208 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pou4f1P17208 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pou4f1P17208 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pou4f1P17208 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms