Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp53P15975 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp53P15975 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp53P15975 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp53P15975 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp53P15975 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp53P15975 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp53P15975 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp53P15975 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp53P15975 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp53P15975 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp53P15975 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp53P15975 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp53P15975 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp53P15975 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp53P15975 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp53P15975 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp53P15975 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp53P15975 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp53P15975 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp53P15975 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp53P15975 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp53P15975 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp53P15975 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp53P15975 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp53P15975 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp53P15975 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp53P15975 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp53P15975 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Usp53P15975 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp53P15975 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp53P15975 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp53P15975 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp53P15975 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp53P15975 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp53P15975 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp53P15975 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp53P15975 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp53P15975 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp53P15975 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp53P15975 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp53P15975 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp53P15975 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp53P15975 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp53P15975 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp53P15975 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp53P15975 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp53P15975 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp53P15975 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp53P15975 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp53P15975 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp53P15975 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp53P15975 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp53P15975 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp53P15975 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp53P15975 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp53P15975 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp53P15975 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp53P15975 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp53P15975 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp53P15975 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp53P15975 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp53P15975 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp53P15975 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp53P15975 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp53P15975 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp53P15975 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp53P15975 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp53P15975 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp53P15975 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp53P15975 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp53P15975 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp53P15975 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp53P15975 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp53P15975 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp53P15975 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp53P15975 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp53P15975 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp53P15975 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp53P15975 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp53P15975 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp53P15975 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp53P15975 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp53P15975 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp53P15975 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp53P15975 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp53P15975 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp53P15975 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp53P15975 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp53P15975 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp53P15975 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp53P15975 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp53P15975 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp53P15975 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp53P15975 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp53P15975 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp53P15975 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp53P15975 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp53P15975 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp53P15975 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms