Protein–RNA interactions for Protein: P15806

Tcf3, Transcription factor E2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf3P15806 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcf3P15806 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcf3P15806 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcf3P15806 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tcf3P15806 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tcf3P15806 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tcf3P15806 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tcf3P15806 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcf3P15806 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tcf3P15806 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tcf3P15806 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcf3P15806 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tcf3P15806 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcf3P15806 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcf3P15806 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tcf3P15806 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcf3P15806 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tcf3P15806 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcf3P15806 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcf3P15806 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcf3P15806 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcf3P15806 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcf3P15806 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tcf3P15806 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tcf3P15806 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tcf3P15806 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tcf3P15806 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcf3P15806 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcf3P15806 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcf3P15806 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcf3P15806 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcf3P15806 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcf3P15806 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcf3P15806 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcf3P15806 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcf3P15806 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcf3P15806 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcf3P15806 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcf3P15806 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcf3P15806 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcf3P15806 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcf3P15806 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcf3P15806 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcf3P15806 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcf3P15806 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcf3P15806 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcf3P15806 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcf3P15806 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcf3P15806 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tcf3P15806 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcf3P15806 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcf3P15806 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcf3P15806 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcf3P15806 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tcf3P15806 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tcf3P15806 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcf3P15806 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcf3P15806 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcf3P15806 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcf3P15806 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcf3P15806 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcf3P15806 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcf3P15806 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcf3P15806 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcf3P15806 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcf3P15806 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcf3P15806 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcf3P15806 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcf3P15806 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcf3P15806 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcf3P15806 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcf3P15806 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcf3P15806 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcf3P15806 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcf3P15806 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcf3P15806 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcf3P15806 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcf3P15806 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcf3P15806 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcf3P15806 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcf3P15806 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcf3P15806 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcf3P15806 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcf3P15806 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcf3P15806 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcf3P15806 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcf3P15806 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcf3P15806 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcf3P15806 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tcf3P15806 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcf3P15806 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcf3P15806 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcf3P15806 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcf3P15806 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcf3P15806 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcf3P15806 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcf3P15806 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcf3P15806 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tcf3P15806 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tcf3P15806 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms