Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cd44P15379 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cd44P15379 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cd44P15379 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cd44P15379 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cd44P15379 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cd44P15379 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cd44P15379 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cd44P15379 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cd44P15379 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cd44P15379 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cd44P15379 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cd44P15379 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cd44P15379 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cd44P15379 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cd44P15379 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cd44P15379 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cd44P15379 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cd44P15379 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cd44P15379 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cd44P15379 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cd44P15379 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cd44P15379 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cd44P15379 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cd44P15379 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cd44P15379 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cd44P15379 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cd44P15379 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cd44P15379 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cd44P15379 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cd44P15379 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cd44P15379 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cd44P15379 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cd44P15379 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cd44P15379 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cd44P15379 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cd44P15379 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cd44P15379 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cd44P15379 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cd44P15379 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cd44P15379 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cd44P15379 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cd44P15379 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cd44P15379 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cd44P15379 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cd44P15379 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cd44P15379 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cd44P15379 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cd44P15379 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cd44P15379 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cd44P15379 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cd44P15379 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cd44P15379 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cd44P15379 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cd44P15379 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cd44P15379 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cd44P15379 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cd44P15379 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cd44P15379 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cd44P15379 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cd44P15379 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cd44P15379 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cd44P15379 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cd44P15379 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cd44P15379 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cd44P15379 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cd44P15379 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd44P15379 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cd44P15379 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cd44P15379 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cd44P15379 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cd44P15379 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cd44P15379 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd44P15379 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cd44P15379 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cd44P15379 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cd44P15379 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cd44P15379 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cd44P15379 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cd44P15379 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cd44P15379 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cd44P15379 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cd44P15379 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd44P15379 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd44P15379 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cd44P15379 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd44P15379 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd44P15379 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cd44P15379 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd44P15379 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd44P15379 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd44P15379 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cd44P15379 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd44P15379 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd44P15379 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd44P15379 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cd44P15379 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd44P15379 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd44P15379 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cd44P15379 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms