Protein–RNA interactions for Protein: P14106

C1qb, Complement C1q subcomponent subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qbP14106 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1qbP14106 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1qbP14106 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1qbP14106 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1qbP14106 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1qbP14106 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1qbP14106 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1qbP14106 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1qbP14106 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1qbP14106 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1qbP14106 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1qbP14106 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1qbP14106 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1qbP14106 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1qbP14106 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1qbP14106 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C1qbP14106 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1qbP14106 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1qbP14106 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1qbP14106 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1qbP14106 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C1qbP14106 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1qbP14106 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C1qbP14106 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C1qbP14106 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1qbP14106 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C1qbP14106 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C1qbP14106 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1qbP14106 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1qbP14106 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1qbP14106 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1qbP14106 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1qbP14106 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1qbP14106 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1qbP14106 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1qbP14106 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1qbP14106 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C1qbP14106 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1qbP14106 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1qbP14106 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1qbP14106 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1qbP14106 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1qbP14106 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1qbP14106 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qbP14106 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qbP14106 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1qbP14106 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1qbP14106 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1qbP14106 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1qbP14106 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1qbP14106 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1qbP14106 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1qbP14106 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qbP14106 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qbP14106 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qbP14106 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1qbP14106 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1qbP14106 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1qbP14106 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1qbP14106 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1qbP14106 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C1qbP14106 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qbP14106 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qbP14106 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qbP14106 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qbP14106 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qbP14106 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qbP14106 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qbP14106 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1qbP14106 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1qbP14106 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qbP14106 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qbP14106 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1qbP14106 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qbP14106 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qbP14106 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qbP14106 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1qbP14106 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms