Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vpreb1P13372 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vpreb1P13372 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vpreb1P13372 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vpreb1P13372 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vpreb1P13372 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vpreb1P13372 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vpreb1P13372 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vpreb1P13372 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vpreb1P13372 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vpreb1P13372 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vpreb1P13372 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vpreb1P13372 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vpreb1P13372 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vpreb1P13372 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vpreb1P13372 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vpreb1P13372 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vpreb1P13372 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vpreb1P13372 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vpreb1P13372 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms