Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FosbP13346 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FosbP13346 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FosbP13346 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FosbP13346 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FosbP13346 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FosbP13346 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FosbP13346 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FosbP13346 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FosbP13346 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FosbP13346 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FosbP13346 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FosbP13346 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FosbP13346 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FosbP13346 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FosbP13346 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FosbP13346 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FosbP13346 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FosbP13346 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FosbP13346 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FosbP13346 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FosbP13346 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FosbP13346 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FosbP13346 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FosbP13346 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FosbP13346 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FosbP13346 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FosbP13346 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FosbP13346 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FosbP13346 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FosbP13346 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FosbP13346 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FosbP13346 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FosbP13346 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FosbP13346 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FosbP13346 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FosbP13346 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FosbP13346 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FosbP13346 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FosbP13346 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FosbP13346 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FosbP13346 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FosbP13346 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FosbP13346 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FosbP13346 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FosbP13346 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FosbP13346 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FosbP13346 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FosbP13346 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FosbP13346 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FosbP13346 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FosbP13346 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FosbP13346 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FosbP13346 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FosbP13346 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FosbP13346 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FosbP13346 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FosbP13346 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FosbP13346 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FosbP13346 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FosbP13346 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FosbP13346 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FosbP13346 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FosbP13346 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FosbP13346 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FosbP13346 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FosbP13346 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FosbP13346 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FosbP13346 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FosbP13346 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FosbP13346 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FosbP13346 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FosbP13346 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FosbP13346 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FosbP13346 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FosbP13346 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FosbP13346 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FosbP13346 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FosbP13346 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FosbP13346 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FosbP13346 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FosbP13346 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FosbP13346 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FosbP13346 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FosbP13346 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FosbP13346 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FosbP13346 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FosbP13346 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FosbP13346 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FosbP13346 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FosbP13346 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FosbP13346 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FosbP13346 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FosbP13346 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FosbP13346 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FosbP13346 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FosbP13346 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FosbP13346 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FosbP13346 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FosbP13346 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.3 ms