Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DmdP11531 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DmdP11531 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DmdP11531 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DmdP11531 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DmdP11531 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DmdP11531 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DmdP11531 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DmdP11531 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DmdP11531 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DmdP11531 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DmdP11531 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DmdP11531 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DmdP11531 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DmdP11531 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DmdP11531 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DmdP11531 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DmdP11531 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DmdP11531 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DmdP11531 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DmdP11531 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DmdP11531 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DmdP11531 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DmdP11531 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DmdP11531 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DmdP11531 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DmdP11531 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DmdP11531 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DmdP11531 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DmdP11531 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DmdP11531 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DmdP11531 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DmdP11531 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DmdP11531 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DmdP11531 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DmdP11531 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DmdP11531 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DmdP11531 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DmdP11531 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DmdP11531 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DmdP11531 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DmdP11531 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DmdP11531 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DmdP11531 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DmdP11531 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DmdP11531 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DmdP11531 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DmdP11531 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DmdP11531 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DmdP11531 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DmdP11531 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DmdP11531 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DmdP11531 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DmdP11531 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DmdP11531 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DmdP11531 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DmdP11531 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DmdP11531 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DmdP11531 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DmdP11531 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DmdP11531 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DmdP11531 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DmdP11531 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DmdP11531 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DmdP11531 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DmdP11531 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DmdP11531 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DmdP11531 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DmdP11531 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DmdP11531 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DmdP11531 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DmdP11531 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DmdP11531 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DmdP11531 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DmdP11531 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DmdP11531 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DmdP11531 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DmdP11531 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DmdP11531 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DmdP11531 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DmdP11531 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DmdP11531 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DmdP11531 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DmdP11531 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DmdP11531 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DmdP11531 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DmdP11531 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DmdP11531 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DmdP11531 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DmdP11531 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DmdP11531 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DmdP11531 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DmdP11531 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DmdP11531 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DmdP11531 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DmdP11531 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DmdP11531 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DmdP11531 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DmdP11531 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DmdP11531 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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