Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd4P10628 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd4P10628 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxd4P10628 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd4P10628 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd4P10628 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd4P10628 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxd4P10628 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd4P10628 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd4P10628 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd4P10628 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxd4P10628 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxd4P10628 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxd4P10628 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxd4P10628 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd4P10628 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxd4P10628 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd4P10628 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxd4P10628 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4P10628 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4P10628 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4P10628 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxd4P10628 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxd4P10628 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4P10628 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4P10628 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4P10628 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxd4P10628 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hoxd4P10628 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4P10628 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4P10628 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4P10628 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4P10628 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4P10628 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4P10628 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4P10628 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4P10628 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4P10628 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxd4P10628 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd4P10628 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd4P10628 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd4P10628 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd4P10628 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxd4P10628 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxd4P10628 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd4P10628 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxd4P10628 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd4P10628 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd4P10628 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd4P10628 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd4P10628 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hoxd4P10628 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd4P10628 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxd4P10628 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms