Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Amd1P0DMN7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Amd1P0DMN7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Amd1P0DMN7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Amd1P0DMN7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Amd1P0DMN7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Amd1P0DMN7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Amd1P0DMN7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Amd1P0DMN7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Amd1P0DMN7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Amd1P0DMN7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Amd1P0DMN7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Amd1P0DMN7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Amd1P0DMN7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Amd1P0DMN7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Amd1P0DMN7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Amd1P0DMN7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Amd1P0DMN7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Amd1P0DMN7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Amd1P0DMN7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Amd1P0DMN7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Amd1P0DMN7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Amd1P0DMN7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Amd1P0DMN7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Amd1P0DMN7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Amd1P0DMN7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Amd1P0DMN7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Amd1P0DMN7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Amd1P0DMN7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Amd1P0DMN7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Amd1P0DMN7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Amd1P0DMN7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Amd1P0DMN7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Amd1P0DMN7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Amd1P0DMN7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Amd1P0DMN7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Amd1P0DMN7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Amd1P0DMN7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Amd1P0DMN7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Amd1P0DMN7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Amd1P0DMN7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Amd1P0DMN7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Amd1P0DMN7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Amd1P0DMN7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Amd1P0DMN7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Amd1P0DMN7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Amd1P0DMN7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Amd1P0DMN7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Amd1P0DMN7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Amd1P0DMN7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Amd1P0DMN7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amd1P0DMN7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amd1P0DMN7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amd1P0DMN7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amd1P0DMN7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Amd1P0DMN7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms