Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Hoxb7P09024 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Hoxb7P09024 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Hoxb7P09024 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Hoxb7P09024 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Hoxb7P09024 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Hoxb7P09024 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Hoxb7P09024 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Hoxb7P09024 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Hoxb7P09024 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Hoxb7P09024 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Hoxb7P09024 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Hoxb7P09024 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Hoxb7P09024 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Hoxb7P09024 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Hoxb7P09024 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Hoxb7P09024 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Hoxb7P09024 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Hoxb7P09024 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Hoxb7P09024 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Hoxb7P09024 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Hoxb7P09024 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Hoxb7P09024 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Hoxb7P09024 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Hoxb7P09024 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Hoxb7P09024 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Hoxb7P09024 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Hoxb7P09024 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Hoxb7P09024 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Hoxb7P09024 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Hoxb7P09024 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Hoxb7P09024 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Hoxb7P09024 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Hoxb7P09024 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Hoxb7P09024 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Hoxb7P09024 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Hoxb7P09024 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Hoxb7P09024 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Hoxb7P09024 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Hoxb7P09024 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Hoxb7P09024 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Hoxb7P09024 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Hoxb7P09024 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Hoxb7P09024 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Hoxb7P09024 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Hoxb7P09024 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Hoxb7P09024 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Hoxb7P09024 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Hoxb7P09024 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Hoxb7P09024 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Hoxb7P09024 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Hoxb7P09024 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Hoxb7P09024 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Hoxb7P09024 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Hoxb7P09024 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Hoxb7P09024 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Hoxb7P09024 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Hoxb7P09024 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Hoxb7P09024 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Hoxb7P09024 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Hoxb7P09024 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Hoxb7P09024 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Hoxb7P09024 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Hoxb7P09024 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Hoxb7P09024 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Hoxb7P09024 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Hoxb7P09024 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Hoxb7P09024 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Hoxb7P09024 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Hoxb7P09024 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Hoxb7P09024 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Hoxb7P09024 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Hoxb7P09024 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Hoxb7P09024 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Hoxb7P09024 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Hoxb7P09024 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Hoxb7P09024 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Hoxb7P09024 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Hoxb7P09024 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Hoxb7P09024 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Hoxb7P09024 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Hoxb7P09024 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Hoxb7P09024 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Hoxb7P09024 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Hoxb7P09024 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Hoxb7P09024 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Hoxb7P09024 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Hoxb7P09024 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Hoxb7P09024 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Hoxb7P09024 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Hoxb7P09024 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Hoxb7P09024 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Hoxb7P09024 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hoxb7P09024 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hoxb7P09024 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hoxb7P09024 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hoxb7P09024 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Hoxb7P09024 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Hoxb7P09024 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Hoxb7P09024 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms