Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csf1P07141 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csf1P07141 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csf1P07141 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csf1P07141 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csf1P07141 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csf1P07141 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csf1P07141 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csf1P07141 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csf1P07141 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csf1P07141 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csf1P07141 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csf1P07141 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Csf1P07141 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csf1P07141 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csf1P07141 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Csf1P07141 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Csf1P07141 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csf1P07141 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Csf1P07141 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Csf1P07141 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csf1P07141 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csf1P07141 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csf1P07141 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csf1P07141 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csf1P07141 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csf1P07141 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csf1P07141 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csf1P07141 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csf1P07141 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csf1P07141 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csf1P07141 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csf1P07141 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csf1P07141 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csf1P07141 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csf1P07141 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csf1P07141 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csf1P07141 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csf1P07141 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csf1P07141 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csf1P07141 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csf1P07141 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csf1P07141 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csf1P07141 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csf1P07141 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csf1P07141 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csf1P07141 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csf1P07141 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csf1P07141 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csf1P07141 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csf1P07141 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csf1P07141 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf1P07141 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf1P07141 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf1P07141 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf1P07141 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf1P07141 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csf1P07141 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csf1P07141 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csf1P07141 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csf1P07141 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csf1P07141 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csf1P07141 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csf1P07141 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csf1P07141 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf1P07141 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf1P07141 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf1P07141 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf1P07141 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csf1P07141 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csf1P07141 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csf1P07141 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf1P07141 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf1P07141 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf1P07141 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf1P07141 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf1P07141 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf1P07141 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf1P07141 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf1P07141 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf1P07141 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf1P07141 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf1P07141 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf1P07141 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Csf1P07141 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf1P07141 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Csf1P07141 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Csf1P07141 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csf1P07141 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csf1P07141 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Csf1P07141 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf1P07141 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf1P07141 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf1P07141 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf1P07141 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf1P07141 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf1P07141 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csf1P07141 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf1P07141 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csf1P07141 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.9 ms