Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P06321 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P06321 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P06321 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P06321 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P06321 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P06321 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P06321 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P06321 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P06321 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P06321 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P06321 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P06321 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P06321 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P06321 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P06321 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P06321 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P06321 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P06321 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
P06321 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P06321 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
P06321 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P06321 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P06321 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P06321 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P06321 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P06321 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P06321 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P06321 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
P06321 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P06321 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P06321 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
P06321 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P06321 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P06321 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P06321 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P06321 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P06321 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P06321 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P06321 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P06321 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P06321 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P06321 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
P06321 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P06321 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P06321 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
P06321 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P06321 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P06321 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P06321 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P06321 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
P06321 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P06321 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P06321 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P06321 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
P06321 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P06321 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
P06321 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P06321 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P06321 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P06321 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P06321 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P06321 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
P06321 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P06321 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P06321 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P06321 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P06321 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
P06321 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
P06321 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P06321 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
P06321 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P06321 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P06321 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P06321 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P06321 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
P06321 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
P06321 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P06321 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P06321 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P06321 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P06321 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P06321 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P06321 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P06321 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P06321 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P06321 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P06321 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P06321 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P06321 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P06321 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P06321 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P06321 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P06321 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
P06321 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P06321 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P06321 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P06321 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P06321 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P06321 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms