Protein–RNA interactions for Protein: P05143

Prp2, Proline-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prp2P05143 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prp2P05143 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prp2P05143 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prp2P05143 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prp2P05143 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prp2P05143 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prp2P05143 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prp2P05143 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prp2P05143 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prp2P05143 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prp2P05143 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prp2P05143 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prp2P05143 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prp2P05143 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prp2P05143 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prp2P05143 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prp2P05143 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prp2P05143 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prp2P05143 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prp2P05143 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prp2P05143 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prp2P05143 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prp2P05143 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prp2P05143 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prp2P05143 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prp2P05143 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prp2P05143 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prp2P05143 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prp2P05143 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prp2P05143 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prp2P05143 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prp2P05143 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prp2P05143 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prp2P05143 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prp2P05143 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prp2P05143 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prp2P05143 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prp2P05143 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prp2P05143 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prp2P05143 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prp2P05143 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prp2P05143 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prp2P05143 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prp2P05143 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prp2P05143 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prp2P05143 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prp2P05143 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prp2P05143 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prp2P05143 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prp2P05143 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prp2P05143 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prp2P05143 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prp2P05143 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prp2P05143 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prp2P05143 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prp2P05143 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prp2P05143 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prp2P05143 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prp2P05143 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prp2P05143 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prp2P05143 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prp2P05143 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prp2P05143 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prp2P05143 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prp2P05143 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prp2P05143 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prp2P05143 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prp2P05143 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prp2P05143 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms