Protein–RNA interactions for Protein: O88892

Serf1, Small EDRK-rich factor 1, mousemouse

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Length 62 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serf1O88892 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Serf1O88892 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Serf1O88892 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Serf1O88892 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Serf1O88892 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Serf1O88892 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Serf1O88892 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Serf1O88892 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Serf1O88892 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Serf1O88892 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Serf1O88892 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Serf1O88892 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Serf1O88892 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Serf1O88892 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Serf1O88892 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Serf1O88892 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Serf1O88892 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Serf1O88892 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Serf1O88892 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Serf1O88892 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Serf1O88892 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Serf1O88892 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Serf1O88892 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Serf1O88892 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Serf1O88892 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Serf1O88892 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Serf1O88892 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Serf1O88892 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serf1O88892 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serf1O88892 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serf1O88892 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serf1O88892 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serf1O88892 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Serf1O88892 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serf1O88892 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serf1O88892 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serf1O88892 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Serf1O88892 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serf1O88892 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Serf1O88892 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Serf1O88892 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms