Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ClppO88696 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ClppO88696 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClppO88696 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ClppO88696 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClppO88696 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ClppO88696 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ClppO88696 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClppO88696 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ClppO88696 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClppO88696 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ClppO88696 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ClppO88696 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ClppO88696 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClppO88696 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ClppO88696 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ClppO88696 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ClppO88696 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClppO88696 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClppO88696 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClppO88696 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClppO88696 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ClppO88696 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ClppO88696 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClppO88696 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClppO88696 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ClppO88696 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClppO88696 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClppO88696 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ClppO88696 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClppO88696 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClppO88696 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ClppO88696 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClppO88696 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ClppO88696 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClppO88696 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClppO88696 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ClppO88696 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ClppO88696 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ClppO88696 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ClppO88696 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ClppO88696 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ClppO88696 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClppO88696 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClppO88696 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClppO88696 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClppO88696 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClppO88696 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClppO88696 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClppO88696 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClppO88696 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClppO88696 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClppO88696 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClppO88696 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClppO88696 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClppO88696 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ClppO88696 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ClppO88696 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ClppO88696 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClppO88696 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClppO88696 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClppO88696 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClppO88696 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClppO88696 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClppO88696 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClppO88696 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClppO88696 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClppO88696 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClppO88696 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClppO88696 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClppO88696 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClppO88696 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClppO88696 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClppO88696 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClppO88696 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClppO88696 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClppO88696 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ClppO88696 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ClppO88696 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ClppO88696 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClppO88696 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ClppO88696 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClppO88696 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ClppO88696 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClppO88696 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClppO88696 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClppO88696 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClppO88696 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ClppO88696 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClppO88696 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClppO88696 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ClppO88696 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ClppO88696 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ClppO88696 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ClppO88696 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ClppO88696 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ClppO88696 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ClppO88696 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ClppO88696 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ClppO88696 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms