Protein–RNA interactions for Protein: O55192

Slc6a2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a2O55192 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc6a2O55192 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc6a2O55192 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc6a2O55192 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc6a2O55192 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc6a2O55192 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc6a2O55192 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc6a2O55192 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc6a2O55192 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc6a2O55192 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc6a2O55192 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc6a2O55192 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc6a2O55192 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc6a2O55192 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc6a2O55192 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc6a2O55192 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc6a2O55192 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc6a2O55192 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc6a2O55192 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc6a2O55192 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc6a2O55192 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc6a2O55192 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc6a2O55192 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc6a2O55192 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc6a2O55192 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc6a2O55192 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc6a2O55192 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc6a2O55192 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc6a2O55192 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc6a2O55192 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc6a2O55192 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc6a2O55192 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc6a2O55192 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc6a2O55192 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc6a2O55192 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc6a2O55192 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc6a2O55192 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc6a2O55192 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc6a2O55192 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc6a2O55192 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc6a2O55192 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc6a2O55192 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc6a2O55192 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc6a2O55192 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc6a2O55192 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc6a2O55192 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc6a2O55192 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc6a2O55192 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc6a2O55192 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc6a2O55192 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc6a2O55192 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc6a2O55192 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc6a2O55192 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc6a2O55192 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc6a2O55192 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc6a2O55192 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc6a2O55192 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc6a2O55192 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc6a2O55192 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc6a2O55192 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc6a2O55192 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc6a2O55192 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc6a2O55192 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc6a2O55192 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc6a2O55192 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc6a2O55192 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc6a2O55192 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc6a2O55192 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc6a2O55192 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc6a2O55192 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc6a2O55192 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc6a2O55192 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc6a2O55192 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc6a2O55192 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc6a2O55192 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc6a2O55192 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc6a2O55192 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc6a2O55192 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc6a2O55192 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc6a2O55192 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms