Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2a2O55143 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2a2O55143 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2a2O55143 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2a2O55143 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp2a2O55143 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp2a2O55143 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp2a2O55143 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp2a2O55143 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp2a2O55143 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp2a2O55143 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2a2O55143 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2a2O55143 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp2a2O55143 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp2a2O55143 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2a2O55143 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp2a2O55143 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp2a2O55143 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp2a2O55143 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atp2a2O55143 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2a2O55143 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp2a2O55143 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2a2O55143 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2a2O55143 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp2a2O55143 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2a2O55143 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp2a2O55143 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp2a2O55143 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp2a2O55143 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp2a2O55143 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Atp2a2O55143 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2a2O55143 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2a2O55143 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp2a2O55143 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2a2O55143 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2a2O55143 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2a2O55143 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp2a2O55143 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2a2O55143 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2a2O55143 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2a2O55143 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp2a2O55143 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2a2O55143 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2a2O55143 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp2a2O55143 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2a2O55143 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2a2O55143 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp2a2O55143 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp2a2O55143 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2a2O55143 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp2a2O55143 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2a2O55143 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2a2O55143 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2a2O55143 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2a2O55143 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp2a2O55143 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2a2O55143 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2a2O55143 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2a2O55143 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp2a2O55143 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp2a2O55143 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp2a2O55143 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp2a2O55143 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp2a2O55143 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2a2O55143 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2a2O55143 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2a2O55143 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp2a2O55143 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2a2O55143 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2a2O55143 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2a2O55143 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2a2O55143 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2a2O55143 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp2a2O55143 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp2a2O55143 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp2a2O55143 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp2a2O55143 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp2a2O55143 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms