Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csnk2a2O54833 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csnk2a2O54833 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Csnk2a2O54833 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Csnk2a2O54833 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csnk2a2O54833 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Csnk2a2O54833 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Csnk2a2O54833 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Csnk2a2O54833 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csnk2a2O54833 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Csnk2a2O54833 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csnk2a2O54833 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csnk2a2O54833 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csnk2a2O54833 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csnk2a2O54833 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Csnk2a2O54833 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Csnk2a2O54833 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csnk2a2O54833 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Csnk2a2O54833 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Csnk2a2O54833 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csnk2a2O54833 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csnk2a2O54833 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csnk2a2O54833 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csnk2a2O54833 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Csnk2a2O54833 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Csnk2a2O54833 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Csnk2a2O54833 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csnk2a2O54833 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csnk2a2O54833 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csnk2a2O54833 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csnk2a2O54833 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csnk2a2O54833 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csnk2a2O54833 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csnk2a2O54833 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csnk2a2O54833 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csnk2a2O54833 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csnk2a2O54833 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Csnk2a2O54833 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csnk2a2O54833 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csnk2a2O54833 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csnk2a2O54833 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csnk2a2O54833 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csnk2a2O54833 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csnk2a2O54833 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csnk2a2O54833 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csnk2a2O54833 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csnk2a2O54833 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Csnk2a2O54833 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csnk2a2O54833 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csnk2a2O54833 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csnk2a2O54833 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csnk2a2O54833 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csnk2a2O54833 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csnk2a2O54833 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Csnk2a2O54833 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csnk2a2O54833 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csnk2a2O54833 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csnk2a2O54833 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csnk2a2O54833 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csnk2a2O54833 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csnk2a2O54833 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csnk2a2O54833 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csnk2a2O54833 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnk2a2O54833 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnk2a2O54833 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csnk2a2O54833 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csnk2a2O54833 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csnk2a2O54833 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csnk2a2O54833 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csnk2a2O54833 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Csnk2a2O54833 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Csnk2a2O54833 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Csnk2a2O54833 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Csnk2a2O54833 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Csnk2a2O54833 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Csnk2a2O54833 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csnk2a2O54833 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csnk2a2O54833 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csnk2a2O54833 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csnk2a2O54833 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csnk2a2O54833 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csnk2a2O54833 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csnk2a2O54833 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csnk2a2O54833 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csnk2a2O54833 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csnk2a2O54833 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csnk2a2O54833 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csnk2a2O54833 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csnk2a2O54833 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csnk2a2O54833 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csnk2a2O54833 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csnk2a2O54833 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csnk2a2O54833 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csnk2a2O54833 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csnk2a2O54833 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csnk2a2O54833 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csnk2a2O54833 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csnk2a2O54833 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csnk2a2O54833 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csnk2a2O54833 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms