Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tpd52l1O54818 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tpd52l1O54818 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tpd52l1O54818 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tpd52l1O54818 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Tpd52l1O54818 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tpd52l1O54818 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tpd52l1O54818 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tpd52l1O54818 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tpd52l1O54818 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tpd52l1O54818 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tpd52l1O54818 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tpd52l1O54818 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tpd52l1O54818 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tpd52l1O54818 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tpd52l1O54818 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tpd52l1O54818 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tpd52l1O54818 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tpd52l1O54818 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tpd52l1O54818 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tpd52l1O54818 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tpd52l1O54818 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tpd52l1O54818 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tpd52l1O54818 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tpd52l1O54818 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tpd52l1O54818 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tpd52l1O54818 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tpd52l1O54818 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tpd52l1O54818 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Tpd52l1O54818 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tpd52l1O54818 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tpd52l1O54818 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tpd52l1O54818 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tpd52l1O54818 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tpd52l1O54818 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tpd52l1O54818 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tpd52l1O54818 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tpd52l1O54818 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tpd52l1O54818 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tpd52l1O54818 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tpd52l1O54818 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tpd52l1O54818 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tpd52l1O54818 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tpd52l1O54818 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tpd52l1O54818 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tpd52l1O54818 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tpd52l1O54818 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tpd52l1O54818 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tpd52l1O54818 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tpd52l1O54818 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tpd52l1O54818 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tpd52l1O54818 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tpd52l1O54818 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tpd52l1O54818 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tpd52l1O54818 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tpd52l1O54818 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tpd52l1O54818 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tpd52l1O54818 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tpd52l1O54818 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tpd52l1O54818 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tpd52l1O54818 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tpd52l1O54818 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tpd52l1O54818 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tpd52l1O54818 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tpd52l1O54818 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tpd52l1O54818 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tpd52l1O54818 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tpd52l1O54818 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tpd52l1O54818 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tpd52l1O54818 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tpd52l1O54818 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tpd52l1O54818 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tpd52l1O54818 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tpd52l1O54818 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tpd52l1O54818 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tpd52l1O54818 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tpd52l1O54818 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Tpd52l1O54818 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tpd52l1O54818 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tpd52l1O54818 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Tpd52l1O54818 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tpd52l1O54818 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tpd52l1O54818 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tpd52l1O54818 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tpd52l1O54818 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tpd52l1O54818 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tpd52l1O54818 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tpd52l1O54818 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tpd52l1O54818 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tpd52l1O54818 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tpd52l1O54818 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tpd52l1O54818 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tpd52l1O54818 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tpd52l1O54818 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Tpd52l1O54818 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Tpd52l1O54818 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tpd52l1O54818 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tpd52l1O54818 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tpd52l1O54818 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tpd52l1O54818 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms