Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EdaO54693 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EdaO54693 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EdaO54693 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EdaO54693 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EdaO54693 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EdaO54693 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EdaO54693 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EdaO54693 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EdaO54693 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EdaO54693 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EdaO54693 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EdaO54693 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EdaO54693 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EdaO54693 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EdaO54693 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EdaO54693 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EdaO54693 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EdaO54693 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EdaO54693 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EdaO54693 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EdaO54693 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EdaO54693 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EdaO54693 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EdaO54693 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EdaO54693 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EdaO54693 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EdaO54693 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EdaO54693 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EdaO54693 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EdaO54693 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EdaO54693 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EdaO54693 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EdaO54693 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EdaO54693 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EdaO54693 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EdaO54693 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EdaO54693 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EdaO54693 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EdaO54693 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EdaO54693 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EdaO54693 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EdaO54693 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EdaO54693 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EdaO54693 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EdaO54693 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EdaO54693 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EdaO54693 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EdaO54693 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EdaO54693 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EdaO54693 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EdaO54693 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EdaO54693 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EdaO54693 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EdaO54693 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EdaO54693 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EdaO54693 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EdaO54693 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EdaO54693 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EdaO54693 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EdaO54693 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EdaO54693 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EdaO54693 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EdaO54693 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EdaO54693 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EdaO54693 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EdaO54693 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EdaO54693 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EdaO54693 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EdaO54693 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EdaO54693 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EdaO54693 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EdaO54693 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EdaO54693 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EdaO54693 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EdaO54693 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EdaO54693 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EdaO54693 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EdaO54693 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EdaO54693 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EdaO54693 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EdaO54693 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EdaO54693 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EdaO54693 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EdaO54693 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EdaO54693 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EdaO54693 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EdaO54693 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EdaO54693 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EdaO54693 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EdaO54693 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EdaO54693 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EdaO54693 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EdaO54693 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EdaO54693 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EdaO54693 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EdaO54693 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EdaO54693 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EdaO54693 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EdaO54693 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms