Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SpibO35906 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SpibO35906 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SpibO35906 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SpibO35906 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SpibO35906 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SpibO35906 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SpibO35906 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SpibO35906 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SpibO35906 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SpibO35906 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SpibO35906 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SpibO35906 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SpibO35906 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SpibO35906 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SpibO35906 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SpibO35906 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SpibO35906 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SpibO35906 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SpibO35906 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SpibO35906 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SpibO35906 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SpibO35906 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SpibO35906 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SpibO35906 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SpibO35906 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SpibO35906 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SpibO35906 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SpibO35906 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SpibO35906 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SpibO35906 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SpibO35906 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SpibO35906 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SpibO35906 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SpibO35906 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SpibO35906 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SpibO35906 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SpibO35906 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SpibO35906 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SpibO35906 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SpibO35906 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SpibO35906 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SpibO35906 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SpibO35906 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SpibO35906 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SpibO35906 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SpibO35906 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SpibO35906 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SpibO35906 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SpibO35906 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SpibO35906 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SpibO35906 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SpibO35906 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SpibO35906 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SpibO35906 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SpibO35906 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SpibO35906 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SpibO35906 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SpibO35906 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SpibO35906 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SpibO35906 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SpibO35906 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SpibO35906 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SpibO35906 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SpibO35906 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SpibO35906 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SpibO35906 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SpibO35906 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SpibO35906 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SpibO35906 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SpibO35906 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SpibO35906 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SpibO35906 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SpibO35906 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SpibO35906 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SpibO35906 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SpibO35906 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SpibO35906 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SpibO35906 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SpibO35906 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SpibO35906 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SpibO35906 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SpibO35906 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SpibO35906 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SpibO35906 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SpibO35906 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SpibO35906 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SpibO35906 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SpibO35906 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SpibO35906 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SpibO35906 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SpibO35906 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SpibO35906 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SpibO35906 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SpibO35906 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SpibO35906 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SpibO35906 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SpibO35906 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SpibO35906 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SpibO35906 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms