Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CaluO35887 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CaluO35887 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CaluO35887 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CaluO35887 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CaluO35887 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CaluO35887 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CaluO35887 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CaluO35887 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CaluO35887 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CaluO35887 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CaluO35887 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CaluO35887 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CaluO35887 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CaluO35887 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CaluO35887 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CaluO35887 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CaluO35887 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CaluO35887 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CaluO35887 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CaluO35887 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CaluO35887 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CaluO35887 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CaluO35887 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CaluO35887 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CaluO35887 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CaluO35887 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CaluO35887 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CaluO35887 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CaluO35887 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CaluO35887 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CaluO35887 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CaluO35887 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CaluO35887 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CaluO35887 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CaluO35887 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CaluO35887 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CaluO35887 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CaluO35887 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CaluO35887 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CaluO35887 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CaluO35887 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CaluO35887 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CaluO35887 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CaluO35887 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CaluO35887 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CaluO35887 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CaluO35887 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CaluO35887 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CaluO35887 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CaluO35887 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CaluO35887 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CaluO35887 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CaluO35887 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CaluO35887 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CaluO35887 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CaluO35887 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CaluO35887 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CaluO35887 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CaluO35887 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CaluO35887 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CaluO35887 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CaluO35887 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CaluO35887 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CaluO35887 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CaluO35887 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CaluO35887 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CaluO35887 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CaluO35887 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CaluO35887 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CaluO35887 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CaluO35887 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CaluO35887 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CaluO35887 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CaluO35887 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CaluO35887 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CaluO35887 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CaluO35887 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CaluO35887 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CaluO35887 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CaluO35887 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CaluO35887 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CaluO35887 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CaluO35887 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CaluO35887 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CaluO35887 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CaluO35887 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CaluO35887 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CaluO35887 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CaluO35887 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CaluO35887 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CaluO35887 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CaluO35887 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CaluO35887 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CaluO35887 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CaluO35887 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CaluO35887 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CaluO35887 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CaluO35887 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CaluO35887 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.8 ms