Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cops5O35864 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cops5O35864 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cops5O35864 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cops5O35864 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cops5O35864 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cops5O35864 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cops5O35864 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cops5O35864 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cops5O35864 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cops5O35864 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cops5O35864 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cops5O35864 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cops5O35864 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cops5O35864 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cops5O35864 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cops5O35864 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cops5O35864 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cops5O35864 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cops5O35864 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cops5O35864 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cops5O35864 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cops5O35864 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cops5O35864 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cops5O35864 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cops5O35864 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cops5O35864 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cops5O35864 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cops5O35864 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cops5O35864 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cops5O35864 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cops5O35864 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cops5O35864 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cops5O35864 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cops5O35864 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cops5O35864 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cops5O35864 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cops5O35864 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cops5O35864 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cops5O35864 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cops5O35864 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cops5O35864 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cops5O35864 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cops5O35864 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cops5O35864 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cops5O35864 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cops5O35864 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cops5O35864 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cops5O35864 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cops5O35864 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cops5O35864 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cops5O35864 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cops5O35864 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cops5O35864 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cops5O35864 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cops5O35864 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cops5O35864 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cops5O35864 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cops5O35864 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cops5O35864 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cops5O35864 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cops5O35864 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cops5O35864 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cops5O35864 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cops5O35864 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cops5O35864 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cops5O35864 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cops5O35864 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cops5O35864 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Cops5O35864 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cops5O35864 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cops5O35864 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cops5O35864 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cops5O35864 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cops5O35864 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cops5O35864 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cops5O35864 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cops5O35864 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cops5O35864 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cops5O35864 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cops5O35864 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cops5O35864 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cops5O35864 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cops5O35864 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cops5O35864 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cops5O35864 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cops5O35864 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cops5O35864 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cops5O35864 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cops5O35864 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cops5O35864 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cops5O35864 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cops5O35864 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cops5O35864 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cops5O35864 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cops5O35864 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cops5O35864 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cops5O35864 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cops5O35864 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cops5O35864 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms