Protein–RNA interactions for Protein: O35719

Rad51b, DNA repair protein RAD51 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51bO35719 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rad51bO35719 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rad51bO35719 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rad51bO35719 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rad51bO35719 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rad51bO35719 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rad51bO35719 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rad51bO35719 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rad51bO35719 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rad51bO35719 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rad51bO35719 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rad51bO35719 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rad51bO35719 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rad51bO35719 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rad51bO35719 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rad51bO35719 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rad51bO35719 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rad51bO35719 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rad51bO35719 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rad51bO35719 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rad51bO35719 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rad51bO35719 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rad51bO35719 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rad51bO35719 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rad51bO35719 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rad51bO35719 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rad51bO35719 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rad51bO35719 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Rad51bO35719 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rad51bO35719 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rad51bO35719 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rad51bO35719 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rad51bO35719 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rad51bO35719 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rad51bO35719 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rad51bO35719 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rad51bO35719 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rad51bO35719 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rad51bO35719 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rad51bO35719 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rad51bO35719 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rad51bO35719 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rad51bO35719 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rad51bO35719 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rad51bO35719 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rad51bO35719 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rad51bO35719 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rad51bO35719 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rad51bO35719 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rad51bO35719 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rad51bO35719 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rad51bO35719 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rad51bO35719 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rad51bO35719 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rad51bO35719 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rad51bO35719 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rad51bO35719 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rad51bO35719 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rad51bO35719 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rad51bO35719 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rad51bO35719 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rad51bO35719 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rad51bO35719 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rad51bO35719 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Rad51bO35719 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad51bO35719 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad51bO35719 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad51bO35719 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad51bO35719 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rad51bO35719 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rad51bO35719 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad51bO35719 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad51bO35719 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rad51bO35719 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rad51bO35719 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Rad51bO35719 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rad51bO35719 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rad51bO35719 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rad51bO35719 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rad51bO35719 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rad51bO35719 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rad51bO35719 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rad51bO35719 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Rad51bO35719 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rad51bO35719 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rad51bO35719 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rad51bO35719 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rad51bO35719 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rad51bO35719 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rad51bO35719 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rad51bO35719 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rad51bO35719 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rad51bO35719 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rad51bO35719 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rad51bO35719 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rad51bO35719 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rad51bO35719 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rad51bO35719 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rad51bO35719 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rad51bO35719 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185 ms