Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Capn6O35646 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Capn6O35646 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Capn6O35646 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Capn6O35646 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn6O35646 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn6O35646 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Capn6O35646 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Capn6O35646 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Capn6O35646 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Capn6O35646 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Capn6O35646 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Capn6O35646 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Capn6O35646 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Capn6O35646 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Capn6O35646 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Capn6O35646 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Capn6O35646 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Capn6O35646 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Capn6O35646 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Capn6O35646 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Capn6O35646 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Capn6O35646 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Capn6O35646 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Capn6O35646 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Capn6O35646 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Capn6O35646 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Capn6O35646 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Capn6O35646 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Capn6O35646 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Capn6O35646 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Capn6O35646 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Capn6O35646 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Capn6O35646 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Capn6O35646 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Capn6O35646 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Capn6O35646 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Capn6O35646 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Capn6O35646 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Capn6O35646 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Capn6O35646 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Capn6O35646 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Capn6O35646 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Capn6O35646 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Capn6O35646 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Capn6O35646 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Capn6O35646 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Capn6O35646 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Capn6O35646 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Capn6O35646 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Capn6O35646 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Capn6O35646 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Capn6O35646 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Capn6O35646 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Capn6O35646 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Capn6O35646 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Capn6O35646 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Capn6O35646 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Capn6O35646 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Capn6O35646 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Capn6O35646 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Capn6O35646 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Capn6O35646 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Capn6O35646 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Capn6O35646 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capn6O35646 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capn6O35646 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capn6O35646 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capn6O35646 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capn6O35646 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capn6O35646 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn6O35646 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn6O35646 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn6O35646 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Capn6O35646 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Capn6O35646 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Capn6O35646 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Capn6O35646 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Capn6O35646 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Capn6O35646 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn6O35646 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn6O35646 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn6O35646 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn6O35646 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn6O35646 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn6O35646 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn6O35646 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn6O35646 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn6O35646 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn6O35646 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn6O35646 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn6O35646 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn6O35646 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn6O35646 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn6O35646 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn6O35646 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn6O35646 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn6O35646 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn6O35646 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn6O35646 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 506.5 ms