Protein–RNA interactions for Protein: O35621

Pmm1, Phosphomannomutase 1, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmm1O35621 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pmm1O35621 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pmm1O35621 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pmm1O35621 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pmm1O35621 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pmm1O35621 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pmm1O35621 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pmm1O35621 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pmm1O35621 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pmm1O35621 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pmm1O35621 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pmm1O35621 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pmm1O35621 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pmm1O35621 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pmm1O35621 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pmm1O35621 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pmm1O35621 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pmm1O35621 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pmm1O35621 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pmm1O35621 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmm1O35621 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmm1O35621 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmm1O35621 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmm1O35621 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pmm1O35621 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pmm1O35621 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pmm1O35621 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pmm1O35621 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pmm1O35621 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pmm1O35621 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pmm1O35621 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pmm1O35621 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pmm1O35621 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pmm1O35621 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pmm1O35621 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pmm1O35621 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pmm1O35621 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pmm1O35621 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pmm1O35621 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pmm1O35621 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pmm1O35621 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pmm1O35621 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pmm1O35621 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pmm1O35621 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pmm1O35621 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pmm1O35621 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pmm1O35621 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pmm1O35621 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pmm1O35621 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pmm1O35621 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pmm1O35621 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pmm1O35621 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pmm1O35621 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pmm1O35621 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pmm1O35621 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pmm1O35621 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pmm1O35621 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmm1O35621 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmm1O35621 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmm1O35621 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmm1O35621 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pmm1O35621 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pmm1O35621 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pmm1O35621 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pmm1O35621 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pmm1O35621 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pmm1O35621 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pmm1O35621 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pmm1O35621 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pmm1O35621 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pmm1O35621 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pmm1O35621 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pmm1O35621 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pmm1O35621 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pmm1O35621 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pmm1O35621 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pmm1O35621 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pmm1O35621 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pmm1O35621 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pmm1O35621 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmm1O35621 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmm1O35621 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pmm1O35621 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pmm1O35621 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pmm1O35621 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pmm1O35621 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pmm1O35621 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pmm1O35621 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pmm1O35621 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pmm1O35621 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pmm1O35621 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pmm1O35621 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pmm1O35621 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pmm1O35621 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pmm1O35621 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pmm1O35621 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pmm1O35621 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pmm1O35621 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pmm1O35621 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pmm1O35621 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.9 ms