Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clk3O35492 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clk3O35492 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Clk3O35492 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clk3O35492 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clk3O35492 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clk3O35492 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clk3O35492 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clk3O35492 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clk3O35492 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clk3O35492 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clk3O35492 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clk3O35492 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clk3O35492 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clk3O35492 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clk3O35492 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clk3O35492 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clk3O35492 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clk3O35492 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clk3O35492 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clk3O35492 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clk3O35492 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clk3O35492 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clk3O35492 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clk3O35492 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clk3O35492 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clk3O35492 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clk3O35492 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clk3O35492 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clk3O35492 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clk3O35492 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clk3O35492 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clk3O35492 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clk3O35492 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clk3O35492 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clk3O35492 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clk3O35492 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clk3O35492 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clk3O35492 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clk3O35492 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clk3O35492 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clk3O35492 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clk3O35492 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clk3O35492 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk3O35492 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk3O35492 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clk3O35492 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clk3O35492 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clk3O35492 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clk3O35492 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clk3O35492 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clk3O35492 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clk3O35492 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clk3O35492 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clk3O35492 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clk3O35492 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clk3O35492 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clk3O35492 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clk3O35492 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clk3O35492 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clk3O35492 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clk3O35492 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clk3O35492 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clk3O35492 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clk3O35492 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clk3O35492 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Clk3O35492 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clk3O35492 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clk3O35492 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clk3O35492 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clk3O35492 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clk3O35492 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clk3O35492 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clk3O35492 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clk3O35492 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clk3O35492 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clk3O35492 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms