Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TnxbO35452 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TnxbO35452 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnxbO35452 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnxbO35452 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnxbO35452 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnxbO35452 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TnxbO35452 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TnxbO35452 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TnxbO35452 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TnxbO35452 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TnxbO35452 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TnxbO35452 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TnxbO35452 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TnxbO35452 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TnxbO35452 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TnxbO35452 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TnxbO35452 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TnxbO35452 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnxbO35452 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnxbO35452 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TnxbO35452 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TnxbO35452 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TnxbO35452 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TnxbO35452 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TnxbO35452 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TnxbO35452 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TnxbO35452 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TnxbO35452 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnxbO35452 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnxbO35452 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TnxbO35452 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TnxbO35452 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TnxbO35452 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TnxbO35452 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TnxbO35452 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TnxbO35452 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnxbO35452 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TnxbO35452 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TnxbO35452 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TnxbO35452 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnxbO35452 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnxbO35452 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnxbO35452 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TnxbO35452 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TnxbO35452 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnxbO35452 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnxbO35452 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnxbO35452 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnxbO35452 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TnxbO35452 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TnxbO35452 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TnxbO35452 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TnxbO35452 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms