Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Pkd2O35245 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Pkd2O35245 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Pkd2O35245 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Pkd2O35245 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pkd2O35245 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pkd2O35245 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Pkd2O35245 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Pkd2O35245 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Pkd2O35245 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Pkd2O35245 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Pkd2O35245 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Pkd2O35245 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Pkd2O35245 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Pkd2O35245 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Pkd2O35245 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Pkd2O35245 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Pkd2O35245 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Pkd2O35245 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Pkd2O35245 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Pkd2O35245 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Pkd2O35245 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pkd2O35245 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Pkd2O35245 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Pkd2O35245 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pkd2O35245 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pkd2O35245 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pkd2O35245 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Pkd2O35245 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pkd2O35245 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pkd2O35245 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Pkd2O35245 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pkd2O35245 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pkd2O35245 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pkd2O35245 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pkd2O35245 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pkd2O35245 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Pkd2O35245 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pkd2O35245 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pkd2O35245 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Pkd2O35245 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Pkd2O35245 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Pkd2O35245 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Pkd2O35245 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Pkd2O35245 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pkd2O35245 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Pkd2O35245 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Pkd2O35245 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Pkd2O35245 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Pkd2O35245 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Pkd2O35245 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Pkd2O35245 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Pkd2O35245 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Pkd2O35245 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Pkd2O35245 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pkd2O35245 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pkd2O35245 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Pkd2O35245 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Pkd2O35245 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Pkd2O35245 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Pkd2O35245 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pkd2O35245 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pkd2O35245 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pkd2O35245 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pkd2O35245 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pkd2O35245 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pkd2O35245 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pkd2O35245 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Pkd2O35245 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Pkd2O35245 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Pkd2O35245 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Pkd2O35245 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pkd2O35245 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pkd2O35245 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pkd2O35245 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pkd2O35245 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Pkd2O35245 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pkd2O35245 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pkd2O35245 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pkd2O35245 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Pkd2O35245 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Pkd2O35245 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pkd2O35245 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pkd2O35245 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pkd2O35245 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pkd2O35245 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Pkd2O35245 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Pkd2O35245 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Pkd2O35245 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pkd2O35245 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pkd2O35245 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Pkd2O35245 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Pkd2O35245 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
Pkd2O35245 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Pkd2O35245 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Pkd2O35245 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pkd2O35245 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pkd2O35245 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Pkd2O35245 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Pkd2O35245 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms