Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MttpO08601 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MttpO08601 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MttpO08601 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MttpO08601 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MttpO08601 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MttpO08601 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MttpO08601 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MttpO08601 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MttpO08601 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MttpO08601 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MttpO08601 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MttpO08601 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MttpO08601 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MttpO08601 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MttpO08601 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MttpO08601 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MttpO08601 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MttpO08601 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MttpO08601 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MttpO08601 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MttpO08601 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MttpO08601 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MttpO08601 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MttpO08601 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MttpO08601 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MttpO08601 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MttpO08601 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MttpO08601 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MttpO08601 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MttpO08601 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MttpO08601 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MttpO08601 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MttpO08601 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MttpO08601 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MttpO08601 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MttpO08601 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MttpO08601 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MttpO08601 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MttpO08601 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MttpO08601 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MttpO08601 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MttpO08601 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MttpO08601 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MttpO08601 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MttpO08601 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MttpO08601 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MttpO08601 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MttpO08601 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MttpO08601 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MttpO08601 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MttpO08601 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MttpO08601 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MttpO08601 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MttpO08601 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MttpO08601 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MttpO08601 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MttpO08601 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MttpO08601 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MttpO08601 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MttpO08601 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MttpO08601 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MttpO08601 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MttpO08601 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MttpO08601 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MttpO08601 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MttpO08601 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MttpO08601 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MttpO08601 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MttpO08601 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MttpO08601 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MttpO08601 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MttpO08601 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MttpO08601 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MttpO08601 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MttpO08601 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MttpO08601 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MttpO08601 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MttpO08601 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MttpO08601 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MttpO08601 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MttpO08601 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MttpO08601 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MttpO08601 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MttpO08601 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MttpO08601 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MttpO08601 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MttpO08601 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MttpO08601 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MttpO08601 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MttpO08601 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MttpO08601 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MttpO08601 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MttpO08601 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MttpO08601 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MttpO08601 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MttpO08601 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MttpO08601 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MttpO08601 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MttpO08601 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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