Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MsmbO08540 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MsmbO08540 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MsmbO08540 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MsmbO08540 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MsmbO08540 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MsmbO08540 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MsmbO08540 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MsmbO08540 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MsmbO08540 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MsmbO08540 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MsmbO08540 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MsmbO08540 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MsmbO08540 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MsmbO08540 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MsmbO08540 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MsmbO08540 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MsmbO08540 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MsmbO08540 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MsmbO08540 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MsmbO08540 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MsmbO08540 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MsmbO08540 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MsmbO08540 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MsmbO08540 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MsmbO08540 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MsmbO08540 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MsmbO08540 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MsmbO08540 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MsmbO08540 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MsmbO08540 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MsmbO08540 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MsmbO08540 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MsmbO08540 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MsmbO08540 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MsmbO08540 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MsmbO08540 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MsmbO08540 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MsmbO08540 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MsmbO08540 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MsmbO08540 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MsmbO08540 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MsmbO08540 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MsmbO08540 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MsmbO08540 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MsmbO08540 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MsmbO08540 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MsmbO08540 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MsmbO08540 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MsmbO08540 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MsmbO08540 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MsmbO08540 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsmbO08540 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MsmbO08540 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MsmbO08540 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MsmbO08540 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MsmbO08540 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MsmbO08540 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MsmbO08540 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MsmbO08540 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MsmbO08540 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MsmbO08540 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MsmbO08540 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MsmbO08540 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MsmbO08540 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsmbO08540 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MsmbO08540 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MsmbO08540 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MsmbO08540 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MsmbO08540 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MsmbO08540 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MsmbO08540 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MsmbO08540 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MsmbO08540 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MsmbO08540 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MsmbO08540 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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