Protein–RNA interactions for Protein: J3QP07

B020004C17Rik, RIKEN cDNA B020004C17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020004C17RikJ3QP07 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
B020004C17RikJ3QP07 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
B020004C17RikJ3QP07 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
B020004C17RikJ3QP07 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
B020004C17RikJ3QP07 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
B020004C17RikJ3QP07 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
B020004C17RikJ3QP07 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
B020004C17RikJ3QP07 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
B020004C17RikJ3QP07 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
B020004C17RikJ3QP07 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
B020004C17RikJ3QP07 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
B020004C17RikJ3QP07 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
B020004C17RikJ3QP07 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
B020004C17RikJ3QP07 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
B020004C17RikJ3QP07 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
B020004C17RikJ3QP07 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
B020004C17RikJ3QP07 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
B020004C17RikJ3QP07 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
B020004C17RikJ3QP07 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
B020004C17RikJ3QP07 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
B020004C17RikJ3QP07 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
B020004C17RikJ3QP07 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
B020004C17RikJ3QP07 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
B020004C17RikJ3QP07 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
B020004C17RikJ3QP07 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
B020004C17RikJ3QP07 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
B020004C17RikJ3QP07 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
B020004C17RikJ3QP07 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
B020004C17RikJ3QP07 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
B020004C17RikJ3QP07 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
B020004C17RikJ3QP07 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
B020004C17RikJ3QP07 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
B020004C17RikJ3QP07 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
B020004C17RikJ3QP07 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
B020004C17RikJ3QP07 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
B020004C17RikJ3QP07 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28■■■□□ 2.07
B020004C17RikJ3QP07 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
B020004C17RikJ3QP07 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
B020004C17RikJ3QP07 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
B020004C17RikJ3QP07 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
B020004C17RikJ3QP07 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
B020004C17RikJ3QP07 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
B020004C17RikJ3QP07 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
B020004C17RikJ3QP07 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
B020004C17RikJ3QP07 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
B020004C17RikJ3QP07 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
B020004C17RikJ3QP07 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
B020004C17RikJ3QP07 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
B020004C17RikJ3QP07 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
B020004C17RikJ3QP07 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
B020004C17RikJ3QP07 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
B020004C17RikJ3QP07 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
B020004C17RikJ3QP07 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
B020004C17RikJ3QP07 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
B020004C17RikJ3QP07 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
B020004C17RikJ3QP07 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
B020004C17RikJ3QP07 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
B020004C17RikJ3QP07 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
B020004C17RikJ3QP07 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
B020004C17RikJ3QP07 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
B020004C17RikJ3QP07 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
B020004C17RikJ3QP07 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
B020004C17RikJ3QP07 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
B020004C17RikJ3QP07 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
B020004C17RikJ3QP07 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
B020004C17RikJ3QP07 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
B020004C17RikJ3QP07 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B020004C17RikJ3QP07 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B020004C17RikJ3QP07 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
B020004C17RikJ3QP07 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
B020004C17RikJ3QP07 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
B020004C17RikJ3QP07 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
B020004C17RikJ3QP07 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
B020004C17RikJ3QP07 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
B020004C17RikJ3QP07 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
B020004C17RikJ3QP07 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
B020004C17RikJ3QP07 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
B020004C17RikJ3QP07 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
B020004C17RikJ3QP07 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
B020004C17RikJ3QP07 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
B020004C17RikJ3QP07 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
B020004C17RikJ3QP07 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
B020004C17RikJ3QP07 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
B020004C17RikJ3QP07 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
B020004C17RikJ3QP07 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
B020004C17RikJ3QP07 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
B020004C17RikJ3QP07 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
B020004C17RikJ3QP07 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
B020004C17RikJ3QP07 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
B020004C17RikJ3QP07 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
B020004C17RikJ3QP07 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
B020004C17RikJ3QP07 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
B020004C17RikJ3QP07 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
B020004C17RikJ3QP07 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
B020004C17RikJ3QP07 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
B020004C17RikJ3QP07 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
B020004C17RikJ3QP07 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
B020004C17RikJ3QP07 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
B020004C17RikJ3QP07 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
B020004C17RikJ3QP07 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms