Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20918J3QN17 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20918J3QN17 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm20918J3QN17 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20918J3QN17 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20918J3QN17 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm20918J3QN17 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20918J3QN17 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20918J3QN17 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm20918J3QN17 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20918J3QN17 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20918J3QN17 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm20918J3QN17 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm20918J3QN17 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20918J3QN17 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm20918J3QN17 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20918J3QN17 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20918J3QN17 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20918J3QN17 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20918J3QN17 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20918J3QN17 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20918J3QN17 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20918J3QN17 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20918J3QN17 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20918J3QN17 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20918J3QN17 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20918J3QN17 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20918J3QN17 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20918J3QN17 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20918J3QN17 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm20918J3QN17 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20918J3QN17 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20918J3QN17 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm20918J3QN17 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm20918J3QN17 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20918J3QN17 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm20918J3QN17 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20918J3QN17 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm20918J3QN17 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm20918J3QN17 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20918J3QN17 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20918J3QN17 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm20918J3QN17 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20918J3QN17 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20918J3QN17 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm20918J3QN17 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20918J3QN17 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm20918J3QN17 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20918J3QN17 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20918J3QN17 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20918J3QN17 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20918J3QN17 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm20918J3QN17 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20918J3QN17 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20918J3QN17 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm20918J3QN17 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20918J3QN17 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20918J3QN17 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm20918J3QN17 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20918J3QN17 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20918J3QN17 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20918J3QN17 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm20918J3QN17 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20918J3QN17 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20918J3QN17 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20918J3QN17 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20918J3QN17 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20918J3QN17 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20918J3QN17 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20918J3QN17 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20918J3QN17 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20918J3QN17 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20918J3QN17 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20918J3QN17 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20918J3QN17 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20918J3QN17 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20918J3QN17 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20918J3QN17 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms